1945년 9월 조선총독부박물관을 인수 개편하여 덕수궁 안의 석조전 건물에서 처음으로 업무를 시작하였다. 1953년 8월 서울환도 이후 잠시 남산 분관에서 머무르다 1954년 10월 덕수궁 석조전으로 이전하고, 1972년 경복궁에 박물관을 신축하여 확장 이전하였으며, 1986년 옛 중앙청 건물로 이전하였으나 건물이 철거됨에 따라 1996년 경복궁 내의 사회교육관 건물을 증개축하여 개관했다. 2004년 10월까지 경복궁에서 운영되다가 2005년 10월 28일 용산가족공원 내의 새로운 건물에서 개관했다.

13만 5000여점의 소장유물 중 약 5000여점의 유물을 18개 전시실에 상설 전시하고 있는데, 지층에는 불교관련 미술품과 공예품 및 역사관련 미술품을, 1층에는 고려시대와 조선시대의 각종 도예품을, 2층에는 선사시대 및 삼국시대의 각종 유물 및 미술품을 전시하고 있다.         

조직은 크게 사무국과 학예연구실로 분류된다. 사무국은 서무과·관리과·섭외교육과로, 학예연구실은 미술부·고고부·유물관리부로 나누어져 박물관특설강좌 등의 사회교육 프로그램을 운영하고, 소장유물 연구와 이를 위한 발굴조사 기능 및 전시·보급 등의 임무를 담당하고 있다.

1. 관람시간 　화·목·금요일 : 오전 9시 ~ 오후 6시    수·토요일 : 오전 9시 ~ 오후 9시(* 야간개장) 　일요일/공휴일 : 오전 9시 ~ 오후 7시

2. 관람권 매표시간 : 관람시간 종료 1시간 전까지 　화·목·금요일 : 오전 9시 ~ 오후 5시    수·토요일 : 오전 9시 ~ 오후 8시(* 야간개장) 　일요일/공휴일 : 오전 9시 ~ 오후 6시 * 야간개장 - 개장시간 : 매주 수·토요일 18:00 ~ 21:00 (3시간 연장)    단, 어린이박물관은 매월 마지막주 수요일만 야간개장(18:00이후는 당일 선착순 발매, 18:00/19:30 150명    씩 2회차) * 매표시간은 20:00까지이며, 관람권은 열린마당 표사는 곳에서만 구매 가능